培養基的優(yōu)化方法
日期:2023-12-22 | 中海生物技術(shù)文庫 | 瀏覽:1598 次
營(yíng)養成分、比列、pH值、滲透壓都會(huì )對微生物生長(cháng)造成影響,怎樣才能達到最佳的組合、滿(mǎn)足微生物生長(cháng)的各項指標?那就需要對培養基進(jìn)行各種優(yōu)化,以滿(mǎn)足微生物的生長(cháng)需要。目前實(shí)驗室常用的有單因素試驗法、正交實(shí)驗設計、響應面優(yōu)化設計法。
單因素試驗法
單因素試驗是指因素間假設沒(méi)有相互作用的前提下,一個(gè)實(shí)驗中只有一個(gè)因素在變化,而其它因素保持恒定不變的實(shí)驗。通過(guò)一次改變一個(gè)因素的水平而其它因素保持水平不變來(lái)確定整個(gè)實(shí)驗中該因素所起的作用,然后一個(gè)個(gè)因素進(jìn)行試驗的優(yōu)化方法。但當實(shí)驗因素較多時(shí),需要多次的試驗次數及較長(cháng)的試驗時(shí)間,才能完成每個(gè)因素的篩選優(yōu)化,最終確定培養基的成分、條件等。單因素試驗法通常是用來(lái)確定碳源和氮源以及它們的配比,然后再進(jìn)行正交試驗。但大多數培養基成分都比較復雜,實(shí)驗因素間經(jīng)常存在交互作用,不能獲得最佳的優(yōu)化結果。所以培養基的優(yōu)化試驗一般不采用單因素試驗法,而采用正交試驗設計法。
正交試驗法
正交試驗法是根據試驗的需要,找出試驗中具有代表性的多因素,利用一套表格選擇多因素、多水平,設計合理的試驗,找出它們之間存在的交互作用,尋找最佳因素水平結合,大大減少試驗次數,較快地取得實(shí)驗結果。正交試驗法利用的是普通統計分析方法來(lái)分析試驗結果,對因素的個(gè)數沒(méi)有嚴格的限制,不管因素之間有無(wú)交互作用都可使用。正交試驗設計的因素、水平合理,分布均勻,不需要反復試驗,誤差小、特別是在試驗因素、水平很多、因素之間的交互作用很多時(shí),正交試驗法具有明顯的優(yōu)勢,單因素試驗幾乎無(wú)法完成。比如吳亞麗等人用正交試驗通過(guò)搖瓶發(fā)酵確定了最佳培養基是基因菌株融合蛋白,用這種優(yōu)化培養基使GST融合蛋白的量提高到1.8g/L,占總蛋白質(zhì)量的25%。
正交試驗法注重的是科學(xué)合理地安排試驗,但它仍有一定局限性,不能找出全部因素和水平之間的關(guān)系,只能是一個(gè)大概值,不能準確給出因素和水平的一個(gè)最優(yōu)值。而且試驗的次數很多,在試驗工作中應用范圍還是受到一的定限制。
響應面優(yōu)化法
響應面優(yōu)化法是利用數學(xué)統計方法找出多因素與響應面之間結合的最佳條件,得出一個(gè)數學(xué)函數方程,用它對受變量影響的響應面進(jìn)行建模和分析,將響應面進(jìn)行優(yōu)化,通過(guò)因素與響應面的函數關(guān)系快速建模,減少實(shí)驗的次數和時(shí)間,用最經(jīng)濟的方法和最短的時(shí)間全面進(jìn)行試驗研究,準確地找到整個(gè)區域內因素與面的函數關(guān)系,從而獲得較好的實(shí)驗結果。響應面優(yōu)化法用回歸函數方程式作為估算工具,將多因素實(shí)驗中因素與響應面的關(guān)系,用多項式來(lái)近似,使其實(shí)驗結果函數化,依據函數方程式對整個(gè)面進(jìn)行全面分析,研究因素與響應值之間,因素與因素之間的關(guān)系,并進(jìn)行優(yōu)化,從而減少實(shí)驗的工作量。姜麗艷、李雪等人用響應面優(yōu)化法對乳鏈菌肽液體發(fā)酵培養基的響應區域進(jìn)行水平的優(yōu)化,優(yōu)化后的乳鏈菌肽效價(jià)是優(yōu)化前的4.48倍。
響應面優(yōu)化法得到的數據更精確、更全面,哪怕是對試驗有顯著(zhù)影響的因素都可以用響應面優(yōu)化法進(jìn)行優(yōu)化。
還有不常用的均勻實(shí)驗設計法、二次正交旋轉組合法、遺傳算法與神經(jīng)網(wǎng)絡(luò )等幾種方法,在培養基優(yōu)化中都會(huì )用到,關(guān)鍵是根據實(shí)驗的需要,這里就不再一一敘述。
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